A vegetação preponderante da área é característica do Campo Cerrado com ocorrência de espécies de transição entre Mata Atlântica e Cerrado. Jequitibá, Gameleira, Copaíba, Candeia e Pau de Tucano são algumas das 51 espécies existentes nos Fechos. Dados da Copasa também revelam que 3 espécies da flora local estão ameaçadas de extinção.
